?湛江灣實驗室朱春華教授團隊與中國水產科學研究院黃海水產研究所陳松林研究員團隊、中山大學林浩然院士團隊聯合完成了東星斑（豹紋鰓棘鱸）的染色體水平基因組精細圖譜繪制，相關研究成果于6月10日在國際重要學術刊物《分子生態資源》（Molecular Ecology Resources）在線發表。
?東星斑，學名豹紋鰓棘鱸，因顏色鮮艷，味道鮮美，深受市場歡迎，經濟價值極高，近年來其養殖規模持續擴大。研究人員采用二代測序、PacBio單分子測序和Hi-C三維基因組技術，組裝了染色體水平的東星斑基因組序列，其中含有24條染色體，全長881.5Mb，含有25248個蛋白編碼基因。比較基因組學分析揭示了東星斑中有126個基因家族顯著擴張，并富集于免疫相關通路。同時，對54個具有不同體色表型的東星斑個體開展了基因組重測序，獲得了518萬個單核苷酸多態性位點（SNP），繪制了東星斑基因組變異（SNP）圖譜。
?東星斑基因組精細圖譜繪制和基因組變異信息鑒定，為東星斑生長、體色等重要經濟性狀的分子機制解析奠定了基礎；同時也為東星斑良種選育提供了重要的基因資源，有助于推動東星斑養殖產業的可持續發展。
?黃海水產研究所周茜副研究員和青島華大基因研究院郭欣雨為該論文共同第一作者，實驗室朱春華教授與黃海水產研究所陳松林研究員、中山大學林浩然院士為該論文的共同通訊作者。該研究獲得了南方海洋科學與工程廣東省實驗室（湛江）資助項目、海洋科學與技術試點國家實驗室（青島）海洋漁業科學與食物產出過程功能實驗室“漁業科技青年人才”培養計劃、鰲山人才培養計劃和水科院創新團隊等項目的資助。
?
全文鏈接：“De novo?sequencing and chromosomal-scale genome assembly of leopard coral grouper, Plectropomus leopardus”. https://doi.org/10.1111/1755-0998.13207
?
東星斑（1齡）
?
東星斑基因組組裝和比較基因組學分析
- 上一篇：湛江灣實驗室順利通過《科研組織知識產權管理規范》認證
- 下一篇：實驗室研究方向
